马援的灵柩运回来的时候，马援的妻子不敢发丧，在城西买了几亩地，草草地把他埋了。马援往日的朋友没有一个人来他家吊丧。马援的妻子害怕光武帝治罪，就同马援哥哥的儿子马严用草绳自缚上朝去见光武帝，向他诉冤。光武帝把梁松等人的信拿给马援妻子看，她才知道丈夫被人诬陷了。于是上书申冤，上了六次，光武帝才决定对他们从宽处理。
在马援的一生中，他交了许多朋友，也帮助了许多朋友，但是当他身陷冤屈时，没有人为他辩解，那些曾经在他的手下做宾客幕僚的，此时都好像哑巴一样。只有一个马援可能都不认得的云阳县令朱勃给光武帝写了一封信，替马援申冤。他在信里说：“我听说好德行的帝王，不忘别人的功劳，看到别人好的东西，不求全责备别人。所以汉高祖赦免了蒯通，并且以帝王的礼节埋葬了田横，大臣们心胸豁达，互相不怀疑。大将在外打仗，小人讲一些坏话，稍微一点过失就记下来，而大的功劳却忘记了，如果就国家的利益来说应该慎重。当初章邯害怕别人说他的坏话投降了项羽，燕将乐毅攻打即墨攻不下，并不是他不愿意攻下，可惜一些花言巧语经常伤害同仁。我听说伏波将军新息侯马援，他曾在陇西很有名，因为钦慕皇上，所以不畏生死，投奔皇上，他为了向皇上进言，经常不顾个人的安危，提出和其他大臣不一样的意见。建武8年，皇上西讨隗嚣，当时众臣都犹豫不定，马援提出了应该进兵的计策，于是平定了陇西。
等到吴汉攻下陇西，但是回来的路却被西羌阻断了，士兵缺衣少粮，处在生死之间，马援奉皇上的命令西进，他镇抚了老百姓，把大军从困苦中解救出来，保住了几乎要灭亡的城池。等到陇西和河北平定，他一个人镇守边关，每次进兵都能为国立功，遇到敌人没有打不败的：攻打先零的时候，他掉入了山谷，敌人的利箭射穿了他的腿骨，但他仍力战不退；出兵岭南的时候，很多士兵都染上了瘟疫，马援几乎要与妻子生别，但他毫不吝惜自己，最后消灭了征侧。这次他南到武陵，很快就攻下了宁乡，本来他为了立功而出师，可是他没有完成自己的誓言却死了，虽然士兵们染上了瘟疫，但是马援自己也没有生还。打仗，有人以为打得久了就应该立功，有人以为快了容易失败，其实深入不一定是对，不进兵也不一定是错，从人的常情出发谁愿意在绝境中长待，不想回来呢？马援为国家做事二十二年了，向北他进过沙漠，向南他渡过大海，他死了以后，竟然被人冤枉。我听说《春秋》中说，有了罪但因为有功可以免除，有德行的皇帝爱护臣子有五种，像马援可以说是为国鞠躬尽瘁而死的了。”
这封信可以说是对马援一生最好的评价。光武帝看到这封信，才允许马援埋入祖坟。但是隔日就好像忘了马援这个人。光武帝待马援多少有些薄情寡恩了。
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