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（二）对《伤寒论》研究的贡献
《要方》的过份略于伤寒，虽然自有其种种因素，但后人总难以谅解而对此颇多蜚言。宋·晁公武③第一个在对《要方》赞颂声中提出没有伤寒的缺点，谓："后世或能窥其一二，未有不为名医者。然议者颇恨其独不及伤寒之数云。"（见《郡垒读书志》）之后又有张杲④批评谓："但是经方无，不该览"（见《医说·三皇历代名医》）。还有李梴责之谓"独于伤寒不及"（见《医学入门》）。叶梦得也在《避暑录话》里以"独伤寒未尽"而引为遗憾。《四库全书总目提要》在责备中予以谅解，谓"妙尽古今方书之要，独伤寒未之尽，似未尽通仲景之言，故不敢深论"。
那末孙氏在写《要方》之际或前，是否读到《伤寒论》的问题，也与年龄生殁之争一样，至今还没有定论。认为没有读过的根据：第一，孙氏自谓："江南诸师，秘仲景要方不传。"（见《要方·伤寒上》）第二，《要方》中的确找不到张仲景的气息。认为读过的，也提出两个更有力的根据，因为《要方·序》、《要方·序例·治病略例》中，俱有大段《伤寒论·序》的原文。这事实客观存在的，不妨予以对照。
《伤寒论·原序》引重庆中医学会编注。重庆市人民出版社版《新辑宋本·伤寒论》1955 年版。《备急千金要方》引人民卫生出版社影印的江户医学影北宋本1955 年版。
《伤寒论·原序》：《千金要方·序》：怪当今居世之士，曾不留神医药，精曰当今居世之士，曾不留神医药，精究方术，上以疗君亲之疾，下以救贫贱之究方术，上以疗君亲之疾，下以救贫贱之厄，中以保身长全，以养其生，但竞逐荣厄，中以保身长全，以养其生，而竟逐荣势，企踵权豪。孜孜汲汲，惟名利是务，势，企踵权豪。孜孜汲汲，惟名利是务，崇饰其末，□忽弃其本，□华其外而淬其□饰其末□而忽弃其本，欲华其表而悴其内，皮之不存，毛将安附焉。□□□□□内，皮之不存，毛将安附□。进不能爱人□□□□□□□□□□□□卒然遭邪风之气知物，退不能爱躬知己。卒然遇邪风之气，婴非常之疾，患及祸至，而方震慄，□，婴非常之疾，患及祸至，而方震慄。身□□□□□□□□□□□□□□降志屈节居厄地，蒙蒙昧昧，戆若游魂。降志屈节，钦望巫祝，告穷归天，束手受败，赍百，钦望巫祝，告穷归天，束手受败，赍百年之寿命，持至贵之重器，委付庸医，恣年之寿命，持至贵之重器，委付凡医，恣其所措，咄嗟呜呼，厥身已毙，神明消灭其所措，咄嗟呜呼，厥身已毙，神明消灭，变为异物，幽潜重泉，徒为啼泣。痛夫，变为异物，幽潜重泉，徒为啼泣。痛夫！举世昏迷，莫能觉悟，不惜其命，若是！举世昏迷，莫能觉悟，不惜自育□□□轻身，彼何荣势之云哉。而进不能爱人知轻身，夫何荣势之云哉。□□□□□□□人，退不能爱身知已。遇灾值祸，身居厄□□□□□□□□□□□□□□□□□□地，蒙蒙昧昧，蠢若游魂，哀乎！② 蒋宝素（1795-1873 年），字问垒，号帝书，清，江苏丹徒人。著有《问垒医案》不分卷，唯分心、脾、肺、肾、肝五个部门，此书编入于《蒋氏七略》中，故又称《蒋氏医略》。③ 晁公武，宋·矩野人，字子止。家富藏书，博学多才，时人尊为昭德先生。撰有《郡斋读书志）20 卷。④ 张杲，字季明，宋·新安（今安微歙县）人。撰有《医说》10 卷，梓行于1224 年。□□□□□□□□□□□□□□□□□□《伤寒论·原序》《千金要方·序例·治病略例》夫天布五行，以运万类。人禀五常，夫天布五行，以植万类。人禀五常，以有五脏；经络府俞，阴阳会通，玄冥以有五脏；经络府俞，输阴阳会通，玄冥幽微，变化难极，幽微，变化难极。易曰，非天下之至赜，□□□□□□□自非才高识妙，岂能探其其孰能与于此。
理致哉。??未之闻也。观今之医，不念□□□□□□□□□□□观今之医，不念思求经旨，以演其所知。各承家技，始终思求经旨，以演其所知。各承家技，始终顺旧。省疾问病，务在口给。相对斯须，循旧。省疾问疾，务在口给。相对斯须，便处汤菜。按寸不及尺，握手不及足，人便处汤菜。按寸不及尺，握手不及足，人迎趺阳，三部不参，动数发息，不满五十迎趺阳，三部不参，动数发息，不满五十，短期未知决诊，九候曾无仿佛，明堂阙，短期未知决诊，九候曾无仿佛，明堂阙庭，尽不见察，所谓窥管而已。夫欲视死庭，尽不见察，所谓窥管而已。夫欲视死别生，实为难矣。别生，实亦难矣。这样铁证如山，孙氏一定读到《伤寒论》的。但我们更要冷静地思索一下，两者之序肯定是"一篇"，关键是在谁抄谁的。《伤寒论》之序出现于宋，显然《伤寒》抄袭于《要方》。此其一。有人提出《伤寒论》的麻黄汤、桂枝汤、大小青龙汤??许多方剂，都在《要方》中出现，孙氏而未读《伤寒论》，怎能搜集到自己的著作中？其实这些方剂，都是当时在临床上广泛使用的常用方。张仲景仅仅用六经辨证学说来予以集成、连贯起来。孙氏的这几首方剂不一定从《伤寒论》中得到的。此其二。
所以此两者而作为孙氏在撰写《要方》之前曾读过《伤寒论》的说法是站不住脚的。
考当时印刷术尚未发达，各种文献传播困难，而且孙氏又野居山林，没有读到《伤寒论》也毫不奇怪。印刷术虽在隋代早已有之，在敦煌也发现过唐·咸通九年（868 年）刻印的《金刚经》，到了11 世纪才普及起来而被医学所利用。孙氏直到《要方》写成或接近写成时的111 岁左右，才获得并刻苦钻研。其所以能获得者，良以进寓京畿而可以遍览天下所有的书之故，终至由深入而精通。他的"白首之年，未尝释卷"（见《要方·序》）、"今年过百岁，研综经文"（见《翼方·针灸上·取孔穴法》），都是说明他在完成《要方》之后，开写《翼方》之前方才得到《伤寒论》而苦读精研的纪录。
孙氏得《伤寒论》后，通过研究及深入领会后，然后写入《翼方》卷九、卷十，非但阐明和发展了它，而且更作出了不可估计的贡献。他把《伤寒论》所有条文，分别按方凭证、比附归类，使用归纳法来整理。把太阳篇分为桂枝汤法、麻黄汤法、青龙汤法、柴胡汤法、承气汤法、陷胸汤法和杂疗法等。在桂枝汤之下，又列桂枝汤、桂枝二麻黄一汤、桂枝麻黄各半汤、桂枝二越婢一汤、桂枝去桂加茯苓白术汤等。这样以按方凭证的归纳，除了条理分清，便于检索之外，更切合于临床实用。
更有意识地突出了麻黄汤、桂枝汤、青龙汤三方的作用，启迪了后世研究伤寒的思路与途径。
还有顺序地叙述阳明、少阳、太阴、少阴和厥阴。再次综合、归纳伤寒治疗的宜忌，列举忌汗、宜汗、忌吐、宜吐、忌下、宜下、忌温、宜温、忌火、宜火，忌灸、宜灸、忌刺、宜刺、忌水、宜水等条文加以说明。然后，再叙述汗、吐、下后病状等等。使学者易于按图索骥，得其要领。
自《伤寒杂病论》面世以后，西晋·王叔和①第一个研究和整理它之后第二人便是孙思邈的《翼方·伤寒门》。
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