然后由朝廷派出监御史到各郡监督执行；郡则派监察人员到各县；县则派检查人员到乡里。
开始还有人观望，也有人赶快挖地窖，筑复壁，将书藏进去，这行动不能请人，也不能在白天公开进行，只能利用深更半夜，邻人、家人都睡着时，偷偷起来摸黑做。
因此，许多白发苍苍的老学究，平生第一次拿起锄头或铁锹，弄得满手都是水泡，但他们为了保存传统文化，没有半点怨悔和恐惧。
这类行动以齐鲁两地进行得最为积极，也是若干年后古文经典出土的唯一来源。
还有的人怕藏书迟早会被找到，干脆将自己的脑子变成书窖，30天内夜以继日地背诵，能记多少算多少。他们也有集体合作的，大家分配你背《周礼》，我背《诗经》，他背《春秋》、《易经》等等，日后再自行写出。
当然，他们为了防止其中有人背叛，全都经过神前发誓、饮血为盟等郑重的仪式。
不过，也有更多的人按照规定将书简交出去。
于是，古籍竹简、羊皮、丝绢手抄卷，以城、乡为单位集合起来焚烧。
北自辽东，南至南海，东自齐地，西至临洮，只要是大秦统治权能及的地方，这30天内，日夜都在焚书。
在眩目的火光下，几千年来先圣、先贤的智慧结晶，无数工匠巧艺体力的付出，全化成飞烟灰烬。
群众有的含泪忍住心痛，远远看着多少代遗留下来的传家之宝，花费了多少祖先心血和时间保存完美的宝书，顷刻间，变成乌有。有的群众就近围观，从他们悲愤的眼光中可以看出他们是多么憎恨秦始皇，憎恨李斯的无知。
所有的群众心头在流血。
30天内，朝廷、郡县使者不断奔驰于途，有报成果的，有请求叙功的，也有要求罚罪的。
原来，秦始皇诏命刚下，不但民间，连很多官员都心存观望，认为这只是一声迅雷，响过了就停。因为焚尽天下古籍，就跟下令天下人都不准吃杂粮一样荒谬！一样无法执行！连李斯派出的监卸史都大部分存有这种看法。
更重要的是，无论大小官吏都是读过书的，多多少少对这些古籍都有一份浓厚的感情和甜美的回忆，毁掉这些古籍也等于否定了自己所有的过去，他们还有什么可以向一般不识之乎的平民，略通文字的商人自傲的？
李斯也发现了大小官员都在敷衍了事，于是，动用了最可怕的特务组织，查报了一些执行不力的官员，以抗命罪名，处斩的处斩，下狱的下狱，这下大家才相信是动真格的，再也不敢松懈，都认真执行了。
30天焚书虽然热闹，害了不少官员定罪，但事情的高潮还在30天限期过后。
各级政府组织搜查队，挨家挨户的搜查古籍，不但翻箱倒柜，而且拆墙毁宅，遇有可疑的地方，掘地三尺。
清廉的官吏是含着眼泪，忍着心痛执行命令，不肖官员正好借此机会大发焚书财。收贿赂可以睁只眼闭只眼。没钱送，目不识丁的人家也要整个翻遍。
更恐怖的是各级政府厉行检举及连坐措施，检举者有重赏，知情不报者同罪。于是，邻居检举邻居，同事告发同事，父亲举发儿子，儿子举发父亲，兄弟相互告发的情形层出不穷。
在这个时期里，各级政府忙着抓人、审问，接受检举，再追捕犯人所招供牵连出来的人，株连的范围越来越大，人数越来越多，不但监狱人满为患，有的贫苦县连囚粮都发不出来，只有下令自备囚粮坐牢，等待押解到北边修筑长城。
这样造成妻离子散的破碎家庭不知有多少，各地押往北边筑长城的犯人更是络绎于道。
秦国本部早已习惯了这种严法酷刑，虽有怨言，还不致于公开反抗。齐鲁等地却是自由惯了的，文风最盛，藏书的也最多，株连的人当然也最多，他们感到无法忍受，决定要采取行动让秦始皇明白民怨。
他们开始秘密集会，夜夜讨论对策。派人到齐、鲁、燕、赵各地联络，筹划一次全国性的示威运动。
在这些儒生的联络和策划下，不少民众向当地郡守县令请愿，得到的答复是抓更多的人，拆更多的房子。
于是，民众发动罢市抗议，闲逛街头议论时政。
原先已消声匿迹的市井游侠，如今又出来展开活动，那班因“装神弄鬼”判罪，遣返原籍限制居住的儒生兼方士，他们最恨赢政，惟恐天下不乱，现在趁机行动，呐喊助威。
这些行动点燃了反焚书的烈火。
政府官员和执行焚书令的办案人员被袭击，一天数起，沿途押解犯人的监史狱吏被杀，犯人被释放。
咸阳城内也出现了官员被害，群众罢市的事情，这在几百年来的秦国来说，是闻所未闻的。
秦始皇异常愤怒，下令追查此案的主谋，重点审查对象是儒家门客及其友人。有些儒生深知秦法严酷，生怕连累亲友，干脆自己投案自首了。
“咸阳儒生挑拨百姓”的案子结案时，受到牵连的有460多名儒生。有些仅仅是因为发表了同情百姓，不满朝政的言论；有些是匿藏古籍；也有些是跟与事者有来往的丞相李斯拟奏书以“坑杀”处理，秦始皇在受到劝谏时气愤地说：“这些人，其中有以装神弄鬼欺骗朕的，也有借以古非今来诽谤朕的，不严加惩治，如何警告天下！”
最后，秦始皇不顾所有方式的劝谏，终于残无人道地下令坑杀了460多名儒生，这充分暴露了秦始皇的专制和暴虐。
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