林则徐为民族仗言，理直气壮，加上劝戒兼施，刚柔并用，使外国烟贩子和义律败下阵来，27日晨6时，义律宣布，以不列颠女王陛下政府的名义并代表政府，将他们各自掌握的鸦片即行缴出，以便转交中国政府，鸦片的价值，将由女王陛下政府随后规定原则及办法，予以决定。接着，具禀林则徐，表示递令缴烟，烟箱数字俟查明后呈报，并请示缴烟地点。
28日，林则徐接到义律呈报实数为20283箱后，按照缴烟令中许诺，派人送上200只牛羊和食物，给断绝供应5天的外商以示犒赏。
但是，义律却不为林则徐的犒赏而以德报德，29日清晨，突然来禀，声称他们“皆受固禁如囚者”，在外洋的趸船“恐不肯顺从缴出”，想来个翻脸不认账。经过封舱、 围商馆的较量， 林则徐看出义律要“另生他计”，当面驳回他的无理要求，责令他通知各英国烟贩，“速即作信交官， 以凭谕知各趸船，次第呈缴，一经缴到，即一切无不照常”。
一计不成，又生一计，30日，义律把传令趸船缴烟的一切事项，推给副监督参逊办理，企图推卸他对缴烟应负的一切责任。 林则徐警告义律，“不得反复无常，自取咎戾”，责令他督促烟贩各自写出趸船名和烟箱数字的英文清单，由其加具总谕呈官，以便持赴趸船次第收缴。并重申：能早一日缴完，即早一日照常通市。为防止义律的拖延抵赖，商馆的防守继续加严。
4月2日，林则徐批准参逊去招徕趸船，并规定虎门外的龙穴岛为缴烟地点。此时，他宣布完全恢复商馆食物和水的正常供应，并酌定限制：鸦片缴出1/4，允许雇用买办、工役；缴到半数， 量许舢板请牌，查验往来；缴到3/4， 准予开舱贸易；缴完，一切照常。
4月3日，参逊与刘开域等一行离粤赴澳门，遍传趸船驶往龙穴缴烟。林则徐最后修改酌定了《收缴趸船烟土章程》， 章程对缴烟的各个环节都作了具体的规定，使缴烟顺利进行。林则徐登上沙角炮台，亲自调度各委员收缴趸船烟土。
从沙角炮台上远眺，龙穴俯首眼底。“沙角台高，乱帆收向天边”。几十年来用万恶的鸦片毒害中国人民的英国侵略者，第一次俯首听命，查禁鸦片的斗争，第一次看到这么大的胜利成果，林则徐心潮起伏，耳边仿佛响起一阵阵春雷，这禁烟的春雷摧毁了外国鸦片贩子藏污纳垢的巢穴，林则徐怎不激情满怀！
就在这个具有历史意义的时刻，林则徐和邓廷桢在沙角炮台上拜发了报告英国烟贩趸船鸦片尽数呈缴的奏折。这折稿， 是他们来到虎门后， 在舟中商定的。他们向道光帝提出：等到收缴烟土完竣之日，准备“派委文武大员将原箱解京验明，再行烧毁，以征实在”。
为了保证收缴烟箱的顺利进行，从14日起，林则徐移住师船“新会”一号，坐镇沙角海口监收。5月2日，林则徐看到验收已逾14000余箱，便决定撤退商馆之围，允许舢板通行，兼准开舱贸易。到18日，趸船鸦片收缴完竣，总计19187箱，又2119袋，比义律原报数字溢收1000余袋。23日，英国鸦片贩子颠地等奉命具结后，被驱逐出境。
24日，义律带着居住商馆内所有的英国人，离开广州，前往澳门。缴烟的斗争，以英国侵略者的彻底失败而告终。
在收缴趸船鸦片，堵塞鸦片来源的同时，林则徐采取一系列果断的措施，扫荡广东的鸦片流毒，他总结了湖广的经验，刊刻了《禁烟章程十条》和各种断瘾药方，颁发全省各地遵照实行。
林则徐的禁烟措施，深受广东人民的热烈欢迎和支持，速戒鸦片告示贴出后，鸦片吸食者纷纷呈缴烟土、烟枪，服药除瘾，“凡家人骨肉、 戚友乡邻，平日劝之不从者，至此皆得悚以功令之严，夺其物以祛所嗜”，形成“一人之瘾，众人断之”的局面。对抗禁烟令者，亦纷纷落网。截至5月20日，两月之中，捕获吸毒、兴贩罪犯1600名，收缴烟土烟膏46.15万两，烟枪4.27万杆，烟锅212口。
随着广东禁烟运动的步步深入，连东北的奉天、吉林、华北的蒙古草原，西南的云南等边疆地区，也都开始取缔烟贩、收缴烟土烟枪、铲除种植罂粟地亩的行动。一些查禁不力的地方官，相继受到处分，吸食鸦片的朝廷官员和宗室，也受到惩治。
从趸船上收缴来的烟箱，全部堆贮在虎门寨下水师提署和附近的民房庙宇，为防范偷窃等弊，林则徐派人带领弁兵昼夜巡逻看守，等待谕旨下达。道光帝接到林则徐奏报，于5月2日下旨允行。旋因8日浙江道监察御史邓瀛上奏，以广州距京遥远，车运不便，且劳民伤财，建议就地销毁。道光帝遂于9日改谕林、邓就地“督率文武员弁，公同查核，目击销毁，俾沿海居民及在粤夷人，共见共闻，咸知震詟”。
在等候道光帝决定处理鸦片的办法之前，林则徐已经广咨博采，找到大量销毁鸦片的有效方法。他和关天培等反复酌商，摸索出挖池浸化的方法，既符合科学道理，又便于大规模销毁。
销烟办法确定后，林则徐设计了挖掘两个长宽各15丈余的方形大池以轮流浸化的方案，并在镇口村码头旁的海滩高地上紧急施工。一切安排就绪，林则徐祭告了海神，确定了在省大员轮流赴虎门查看销烟的次序，决定在6月3日首次销烟。
6月3日午后二时许，林则徐在怡良、豫堃陪同下，登上礼台。在礼炮声中，震动中外的虎门销烟开始了。只见一群群袒胸赤脚的民工，站在横跨销烟池的数条木板上，撒下盐巴，又把劈箱过秤后的鸦片，逐个切成四小瓣，抛入池内。经过一段时间浸化，再把一担担烧透了的石灰倒下去，用铁锄、木耙反复翻戳。顿时，销烟池沸滚如汤，不爨自燃，“浓油上涌，渣滓下沉，臭秽熏腾，不可向迩”。远近山峦欢呼雷动，好似山起海翻，甚为壮观。一池销毁完毕，即打开涵洞，冲刷入海，另一池又开始了紧张的浸化。至夕阳西下，已有170箱鸦片尽化为渣沫，流向大洋。
这个伟大的行动，向全世界表明中国人民反抗外来侵略的坚决性，并一洗贪官污吏所加予中国的耻辱。
销烟的壮举振奋人心，端午节前后，远近群众前来观看者“愈见其多”。
为了让外国人“共见共闻”，6月13日，林则徐发出告示，准许外国人到销烟现场参观。义律从答应缴烟开始，根本不相信林则徐会销毁鸦片，于15日下午赶往参观，林则徐允许他们走进栅栏内观察销烟全过程。在事实面前，他们不得不佩服中国人办事认真负责。林则徐还利用这个机会，向他们了解英国海军的实力，他估计到英国侵略者不会甘心失败，甚至进行武装挑衅，但他没有退缩，庄严地宣告：我们不怕战争！
整个销烟过程历时20天，共销毁鸦片19179箱，又2119袋，实重2376254斤。留下公班、小公班、白土，金花烟土各两箱，预备解京作为样土。
6月25日，林则徐、邓廷桢等满怀胜利的喜悦，登舟离开虎门，返回广州。
林则徐主持虎门销烟，是清朝政府抵制外国鸦片侵略的“顶点”。他的名字，是这场关系到中华民族存亡续绝斗争的一面战斗旗帜。毛泽东曾精辟地指出：我们的民主革命，从林则徐算起，一直革了100多年。把林则徐禁烟抗英事业的标志——虎门销烟，作为中国人民反帝斗争的伟大起点。在这个意义上，林则徐为中华民族立下了殊勋，是中国近代第一位杰出的民族英雄。
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