孙中山在确立了实行武装斗争的方针之后，就面临着武装斗争走什么道路的战略问题了。
孙中山的武装斗争生涯，是从宣传鼓动和筹饷开始的，他起初认为只要有了“愿意干”的人和钱买枪支弹药，便可以进行遥控起义，他把指挥部设在海外和香港，对国内的武装起义进行膑近指挥。但由于清政府与孙中山留居国和地区交涉，弄得这些国家和地区政府驱逐孙中山，使他在临近中国的地方，如日本、越南、南洋各地均无法立足。孙冲山认识到国内无根据地，便无法组织训练部队，无法取得军械弹药等后勤保障，更无法宣传和组织群众。
1895年，孙中山以香港为活动基地，筹划发动广州起义时，就制定了“袭取广州以为根据”的计划，并有了向北发展的战略意图。
1897年至1898年，孙中山在日本与宫崎寅藏讨论研究中国军事斗争的战略时，提出了武装斗争总的战略方针。他说：“我辈须静观清政府之所为如何，暗给日、英两国为后劲，我同志之士相率潜入内地，收揽所在之英雄，先据有一二省为根本，以为割据之势，而后张势威于四方，奠定大局也。”
孙中山这一战略方针的核心是“割据”，并认识到了割据必须是武装的，要不然就会“地方豪杰互争雄长，亘数十年不能统一”的局面。他还意识到了割据是武装夺取全国政权的必由之路。他认为，只有先“割据”，然后以此为基地，发展势力，“张势威于四方”，才能最后推翻清王朝，建立共和。
孙中山选择南方的粤桂滇三省作为根据地，三省之中又“以广东为最善”。选择南方三省特别是广东作为根据地是有他的战略思想的。一是南方各省反清的会党势力较集中强大；二是这几省的华侨多，而孙中山早年的革命活动就是在华侨中展开的，从海外取得财力物力的支援方便得多；三是清政府的政治军事重心都在北方，南方力量相对薄弱一些；四是南方几省经济较发达，有建设根据地的财源基础，便于进一步发展，孙中山在《致邓泽如函》中说：“南宁为广西之中心点，得南宁，则北取桂林以出湖南，东取梧州以出广东，革命之基础可固。”“有两广为根本，治军北上，长江南北及黄河南北诸同志，必齐起响应，成恢复之大功，立昌明之政体。”后由于革命形势的发展，根据地集中到广东，尤其是广州。
1916年的讨袁战争，也以广东为根据地。孙中山仔细分析了当时的时势，制定了战略方针。他说：“长江一带，敌屯重兵，且有津浦、京汉两线运输之利，急于争衡，过费资力，刻下决注全力于粤省，旁及福建、闽、粤一下，与云贵打成一片，南方局势，已足自治。”但由于根据地建设不力，付袁战争失败了。
1921年5月5日，经过了护法战争失败后的孙中山在广州第二次建立政权。他认为新政权的主要任务是建立一个政治上民主，军事上统一的根据地，以作为北伐的大本营，彻底消灭一切军阀统治，统一全国。他就根据地的建设作了很多的探索和尝试。最突出的就是关于根据地内党、政、军统一的思想和实践，强调指出根据地必须由革命党领导，根据地必须加强政权建设，加强民主政治，根据地必须实行军令统一，军政统一，使武装力量为革命党和革命政权所掌握的重要原则。1921年4月4日，孙中山详细阐述了“五权宪法”和国家机关的组成，规定了军政部设于政府行政院下。同月，又在《陆军部官制令》中规定：“陆军总长承大总统大命。”这样，就为根据地军政统一的组织建设打好了基础。
在组织建设打好基础之后，孙中山开始了军事上巩固两广革命根据地的行动。孙中山下一步的战略就是剿灭桂系，平定西面了。他认为取得广西后，可解除广东侧翼威胁而巩固广东，消除后顾之忧，而可转入军事大进功，实现北伐的宏图。当时桂系军阀与北京政府勾结起来了，陆荣廷集兵15000于梧州准备反攻广东，北洋军三路出兵“援粤”。革命只能采取果敢措施了。5月28日，孙中山命陈炯时出肇后趋梧州，命许崇智由北江迎击沈鸿英，命李烈钧统一指挥滇、黔、赣军由湘黔向桂林、柳州进攻，并电告赵恒锡派兵助战。经过四个月的艰苦奋战，革命军捣毁了桂系老巢龙州，陆荣延本人也亡命越南。孙中山将广东广西联成一片而建立革命根据地的战略目标得到了实现。
但革命根据地的巩固问题由于陈炯明和沈鸿荣的叛乱和武力进攻广州而受到了威胁。经过艰苦的斗争，1923年，孙中山重返广州，建立了陆海军大元帅府。他这一次建设政权是要实行新三民主义和三大政策，改组国民党，重建革命根据地来进行北伐。他说：“十三年以前，我们都是用广州做革命的起点，广州是革命党的发源地，是很光荣的。我们想重新再建民国，还要拿这个光荣的地方作为起点。好比做新屋一样，必须选好一个好屋基，广州市就是我们创建民国的好屋基。”“速谋恢复广东之秩序，以广东政府为中心，谋中国之统一，以开导各省。”
在讨伐陈炯明和沈鸿英之后，孙中山关于广东根据地的建设思想有了新的发展，他作了建立政权、动员组织民众和统一财政、收回关作余三个方面的努力。广东根据地军政政权的建立使得军事斗争和政权建设密切结合起来。促进了根据地的巩固和发展；统一财政、收回关余的措施，整顿了军队丰裕了军饷也促进了根据地的巩固和发展；认识到人民群众的“实力异常伟大，而其力大于枪炮十倍百倍而已”，广东根据地的生存发展，需要“有组织的民众为后援”。1924年10月镇压商团叛乱，巩固广东革命根据地，就是依靠民众革命斗争必须与民众相结合，是他巩固根据地思想的重大发展。
广东革命根据地巩固与发展，为北伐打好了坚实的大本营基础，为1924年年底的北伐扫清了障碍，并为其初期的胜利奠定了基础。
孙中山在辛亥革命时期的军事思想和军事实践，都在努力建立一块是可以与北方政府抗衡的根据地，并希望以根据地为大本营，北伐统一中国，建立共和。并且孙中山运用民众基础和武装实力相结合的原则来选择根据地，在根据地内实行政治与军事并重的措施，以及根据地向纵深发展的构想，都是极有价值的。
革命根据地是革命的策原地和革命的突破口，孙中山在广东播下了革命的种子，用他的革命思想教育了广东人民，还在根据地里建立了军校和革命军队，为全民革命输送了大批人才。广东革命根据地的建立，对全国有着巨大的影响，使革命之花在全国开放，是旧民主主义革命史上不可或缺的一页，也为新民主主义革命打下了基础。
孙中山在武装革命中没有走中国几千年来农民起义流窜作战的老路子，而是开创性地走建设革命根据地为路子，对当时的时势而言是英明的时期。
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