在世界医学史上独树一帜的切脉，此切脉法是我国传统中医学中的望、闻、问、切中之一，已有数千年历史，历代医家积累了丰富的经验，留下了不少脉学专著。但脉学中存在不少颇有争论的问题。李时珍批判地继承历代医家的脉学思想，结合自己的临床实际经验，充实发展脉学理论体系，撰写脉学指南——《濒湖脉学》。
脉学发端于《黄帝内经》。扁鹊被称为脉学之祖。
从《脉经》问世到李时珍时代，经历千年发展曲折的道路。在理论体系上，没有大的突破。六朝时高阳生编写了《脉诀》，托名王叔和撰，因该书采用歌诀形式，易诵易记，书中虽错误很多，仍流行不衰。一直延续到李时珍的父亲在其所著《四诊发明》中，对《脉诀》的错误曾予以纠正，并对宋代崔紫虚（嘉彦）用四言诗写的《脉诀》（《崔氏歌诀》）加以修改。李时珍继承并发展他父亲的思想，写成二十七脉的《体状诗》、《相类诗》、《主病诗》和《分部诗》。
因《脉诀》书中错误很多，理论不清，初涉医学的人也不易了解，因此李时珍于公元1564年，在其父亲所著的《四诊发明》和前人所著的《脉经》基础上，编著了《濒湖脉学》，使长期以来医家的临床经验得以发展并加以总结。用新的科学内容去充实《脉经》，建立新的脉学体系，王叔和撰《脉经的旨趣》，主要是从难到简，把脉象归纳为24脉。李时珍在濒湖脉学》中把脉象发展为27种，李时珍并按对立统一原则，将相反相成的脉象，如浮与沉、迟与数、滑与涩、虚与实、长与短、洪与微、紧与缓，排列连起，便于人们前后比较，仔细琢磨其间的区别与联系，继承前人脉学思想，突出浮、沉、迟、数四脉，更具有深刻用意。李时珍将原来24脉发展为27脉，其旨在于由简单而充实，发展已有的经验；进而从27脉中突出浮、沉、迟、数四脉，则是以简单的言语说明道理，便于掌握纲领。这样就恰当地处理了博与约、繁与简的辩证关系。在脉象的分类上，李时珍也作了新的发展。《濒湖脉学》仍以阴阳类脉，又首创四分法，提高了脉学的实用价值和科学性。既有批判继承，又着重于新的创造。
为便于初学与记忆，《濒湖脉学》仍以诗歌韵体，易诵易记，科学内容，辅以喜闻乐见的形式，大受后人欢迎。全书深入浅出，通俗易懂，其中脉理阐述精辟，言简意赅，为历代医家所喜欢。此书于1927年流传在国外，并被译成德文，1929年又刊行于莱比锡，风靡世界医苑。
公元1572年，李时珍研究奇经，写出《奇经八脉考》。他对于经络学的研究，也表现出超群卓越的才能。
祖国医学认为人体是一个有机统一的整体，全靠经络系统来交通脏腑、营卫、血气。经络之中，有正经，还有奇经。且详于“正”，而略于“奇”，当时人们都十分遵循精典古籍，不敢越雷池一步，对此，李时珍感到憾事。李时珍在研究脉学过程中，对奇经尤为留意，这是他的又一项开拓性科学研究。李时珍将散见于《内》、《难》等医典中关于奇经的论述作了深入研究，系统整理，对历代医家众说纷纭，莫衷一是的问题，进行精心考辨，根据自己的实践经验，作出详细论述，从而使人们对奇经有了完整系统的认识，发现奇经八脉在人体之生理、病理，以及辨症论治各方面，都占有重要地位。奇经八脉的名称是：任、督、冲、带、阳践、阳维。《奇经八脉考》，是李时珍总结整理出来的关于奇经的特殊切诊方法。李时珍在《奇经八脉考》之后，绘有《气口九道脉图》，他认为奇经八脉，世上都无人知道，今绘此图的目的就是为世人揭开这千古之秘。
《濒湖脉学》根据临床经验，奇经八脉为主的病症，在此一一作了论述。《奇经八脉考》的撰写，是李时珍对祖国医学发展又一创造性贡献。
李时珍本来留下许多记录一生亲身实践经验成功的医案，并曾将此编撰为《濒湖医案》一书，只可惜早已失传。只有十多条医案保留在《本草纲目》一书中，每条医案都是理、法、方、药的具体运用，非常宝贵。每个医案，都有一个李时珍为他人治病的小故事。
一则医案记载：有一个患者十分喜欢喝酒，常常狂饮。在一个非常寒冷的季节，有一天因去墓地哭祭母亲而受了些凉，生了病而且十分怕冷。每餐饭必须吃姜蒜，否则就不能下咽。发病的时候，从腰到胸口都胀痛，频繁地小便，想吃酸东西，出现吐水、腹泻、阳萎、昏厥等症状。服用了许多医生开的温脾、胜湿、滋补、消导等各种药，可都是时好时坏。于是找到李时珍。李时珍在古方的基础上加了些改变，终于治愈了此病。后来他在医案中记载：这是由于不注意调节饥饱劳逸，伤了体内元气，抑制了体内清阳之气的流通散发。他开出了“用升麻葛根汤合君子汤，加柴胡、苍术、黄芪煎服”的药方并让患者服了药后，喝一二杯酒。那人照此方服后，效果非常好。喝了药后，觉得清气上行，胸膈十分畅爽，手脚都暖和过来了，头脑清晰，眼睛明亮，精神焕发，各种病症都没了。每次一复发只要照此方服一剂药就好了，真是神了。要是减去升麻、葛根，或者不喝酒，药效就会差一些。
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