自从1939 年第七三一部队移防到平房附近以后，哈尔滨市及其周围便接连不断地发生奇怪的灾难——突然流行各种急性传染病。
1940 年夏天，位于当时新京（长春）西北50 公里的吉林省农安县，突然发生了混合鼠疫。更奇怪的是，主要应在冬季流行的鼠疫，却在夏季流行起来。鼠疫开始发生在县城内，几天后蔓延到城外的农村地带，发病者一个又一个地相继死去，死者达300 多人。
同年，在哈尔滨市的傅家甸地区，突发过伤寒病。当时传说是因为有人往水源里撒了病菌，死者不少。这次伤寒病，甚至把当时住在哈尔滨的近10万日本人也卷进去了。
就在哈尔滨市发生伤寒的同一时期，新京（长春）火车站后面，离车站北面附近1 公里地密集的贫民街，突然发生了鼠疫。
接着是位于离哈尔滨市东北方20 公里处附近的满蒙开垦团里，饲养的羊和马突然患了原因不明的病，接连不断地大批死亡。
这些各地的传染病，其实都是弟七三一部队和关东军特务机关联合作战，人为地发生、人为地平息的。它是以市、街、区为舞台，进行大规模的细菌战“实验”。
除了以人为对象的细菌战研究，以七三一部队的研究实验为基础，日本侵略者还新设了以家畜和植物为对象的细菌战部队——第一○○部队。关东军司令部交给该部队的主要任务是：“开始对苏作战的时候，一旦日本因作战的需要转移到大兴安岭的话，就用细菌和烈性毒物污染所有的河川、贮水池和水井，要让所有的农作物荒废，让牛羊全部死光。”第一○○部队进行了家畜传染病和毒物实验。
中国有句老话，叫作：“善有善报、恶有恶报，不是不报，时候未到。”崩溃和逃跑的日子，终于降临到活主生地把3000 多人作为细菌战实验材料加以残杀、肆无忌惮地实施着暴虐的第七三一部队自己头上。日本帝国主义的失败，带来了七三一的崩溃。
1945 年上半年，整个战局对日本帝国主义越来越不利。2 月，在苏联克里米亚雅尔塔的利瓦吉亚宫，罗斯福、丘吉尔、斯大林代表着已稳操第二次世界大战胜券的“三巨头”——美、英、苏三国，开会讨论了对战后世界问题的处理意见。2 月11 日，“三巨头”在秘密的《雅尔塔协定》上签字。美国同意苏联在远东的一切领土要求和主权要求，其中包括外蒙古独立、恢复日俄战争前俄国在远东的权益等。作为交换条件，苏联同意在战胜德国3 个月内对日宣战。
5 月2 日，苏军攻克柏林，德国法西斯政权无条件投降。日本法西斯的丧钟已经敲响！
从同年4 月份以来，1000 多架美国飞机，接连对东京狂轰滥炸，皇宫、皇太后宫、明治神宫等处相继中弹，东京成为一片火海，到处断垣残壁，与此同时，斯大林命令第三十九集团军、第五集团军、第五十三集团军、第六近卫坦克集团军从刚刚结束战斗的欧洲战场调回国内，作好对日作战的准备。6 月，在克里姆林宫，刚刚接受“苏联最高大元帅”军衔的斯大林召集苏联红军远东作战会议。他决定：3 个月内打败关东军，命令苏联红军立即开赴远东前线。
此时，昔日号称“无敌的70 万关东军”已无往日的威风。随着南方战线局势的恶化，其主力已有20 个师团被抽调到南方各地，剩余部队的装备和战斗力都很差。可以说，关东军握着的唯一“现代武器”，就是第七三一部队的各种细菌和毒药。
石井四郎部队长清醒地意识到末日的来临。5 月，他集合部队干部作了“日苏开战势在必然..今后七三一要全力以赴，突击细菌和跳蚤、老鼠的增产”，提出要为今后实施细菌战作准备。
七三一部队已经发明了鼠疫菌的干燥保存法——制造干燥菌的技术，生产了具有比通常鼠疫菌高60 倍毒素的变性菌。鼠疫菌雨化技术已取得相当进展，陶器炸弹业已完成，并正在大量繁殖一种生存能力特别强的老鼠和“具有最有效的吸血能力的跳蚤”。“5 月10 日下达了这样的命令：今后的两个月之间必须大量生产鼠疫苗，以及投放水井、贮水他的伤寒菌、霍乱菌、污染河流和牧场的炭疽菌。..柄泽班增加了人员，进入了24 小时生产的体制..。其结果，光鼠疫菌就生产了近20 公斤..包括已储存的，加上干燥菌，我想已达到100 公斤。”这是原队员的证言。据原队员说：在战争结束前夕，第七三一部队作为“可以使用”保存的各种细菌数量达到了“如果全部用理想的方法散布的话，地球上人类就会统统死光”的程度。
规定鼠疫跳蚤的增产目标是“300 公斤”（约10 亿只）。据说田中班有4500 个跳蚤饲养器，在短短几天内就能确保生产1 亿只跳蚤。“但是，要生产马上就能使用的、活生生的10 亿只跳蚤，这可不是简单的事..。听说要在这么多跳蚤身上撒上鼠疫菌，把它们统统放到苏联军队，撒到城市里去..，我真感到这简直太不寻常了。”一个原队员这样追述往事。
下达了以“增产300 万只老鼠”为目标的号令，为了捕获老鼠，组织了“特攻队”，队员们在卡车上装了大量的捕鼠器。在哈尔滨、新京（长春）的各市街到处转，还动员居民、学生去捕鼠。
死到临头的第七三一部队开展的细菌、跳蚤、老鼠增产运动，达到走火入魔的程度，但它并不能挽救其覆灭的下场。
8 月6 日凌晨2 时45 分，美国提尼空军基地上的“思诺拉，格”号B—29 轰炸机起飞。6 个半小时后，飞机到达日本广岛上空，投弹手费雷比少校按动了投弹按钮。
广岛上空600 米，一个巨大的火球发出天崩地裂的巨响，蘑菇云滚滚上升——世界上第一颗新型的大面积杀伤性武器原子弹爆炸了，死神在广岛上空降临。
3 天后，又一颗原子弹在长崎上空爆炸。两弹原子弹，夺去了30 多万无辜人民的生命，他们成了日本军国主义的陪葬品。
8 月8 日，苏联对日宣战。斯大林命令：8 月9 日0 时，进攻开始。
8 月9 日0 时，暴雨裹着狂风，电闪夹着雷鸣，苏联红军5500 辆坦克同时向日军阵地冲来；1000 多架轰炸机冒雨起飞，许许多多的海军舰艇蜂拥而至。长达4400 公里的中苏边境上，苏联红军后贝加尔方面军、远东第一方面军、远东第二方面军、外蒙骑兵团，总计150 万兵力，在总司令华西列夫斯基元帅的指挥下，向日军同时发动攻势，轻而易举地突破了日军的防线，以惊人的速度向我国东北全境和朝鲜推进。
“苏军开始进攻了”，犹如晴天霹雳，使在东北的关东军及其他在华日本人陷入大混乱之中，第七三一部队的队员及其家属也骚然不安。
8 月10 日天刚亮，关东军司令部给石井部队长发来了“前来接受命令”的电报。
但是，石井部队长已经一天没有露面了，去向绝密，谁也不知道。部队的长官慌忙让N 副官前往新京（长春）受命。
N 副官来到乱成一团的关东军司令部，关东军司令宫山田乙三已飞往外地。N 副官禀告自己是前来接受命令的，司令部下达的命令是：“苏军进攻速度迅速，关东军各部队已开始南下转战，七三一部队可以独断专行。”
N 副官返回七三一部队，已是8 月10 日晌午。命令很清楚，要求七三一部队自行决定撤退事宜。上层领导骤然感到形势紧迫，立即召集了紧急会议。
当天夜里，石井四郎部队长回到七三一，他重新召开了撤退会议。会上，石井部队长和菊地少将（第一部部长）等的意见尖锐对立，据说，发生了激烈的争论。
石井部队长的撤退方案是：①保守七三一部队的秘密是最大的问题。②由已派去的西中校（教育部长）向苏联军队进攻途中的海拉尔、孙吴、牡丹江各支部的七三一队员下达消灭证据及全体自杀的命令。③向往在东乡村官舍的队员、家属们下达以此为榜样，全体自杀的命令。④目前收容在监的“原木”一个不留，统统杀死；与此同时，“彻底”破坏“口号”栋建筑，部队的设施由工兵进行爆破。⑤全体人员，包括少年队南下至通化。
激烈争论的原因，出在石井方案的②③上。菊地少将主张“在六三一部队里有许多有才能的研究人员，与其逼他们白白自杀，先决的倒是要拟定出挽救支部的计策。”他口气强硬地说：“部队长应带头作出努力，让队员的家属返回日本内地。”
最后，石井部队长作了让步，决定“家属立刻开始撤退，部队长到各地去部署列车运输，指挥各支部撤退。”石井部队长又重新在七三一部队消失了。
这期间，石井做了三件事。第一是把七三一积累的、为准备细菌战的各种资料，大量的实验数据、菌种带回日本；第二是安排七三一撤退的列车优先通过，避免让苏军抓到俘虏。为此，他最大限度地使用了七三一航空班所属的军用飞机；第三是专门将特别班员紧急避难，因为特别班员都来自石井
家乡，是七三一部队的核石井部队长给特别班员下达的直接命令是：“把‘原木’杀死之后，全体人员立即紧急撤退！”也就是说，七三一的善后你们不要管，杀完‘原木’以后马上撤离。
8月10日，特别班用毒瓦斯杀死了关押在特设监狱中的全体“原木”，总共40多人。
自从“原木”叛乱后，特设监做的换气装置又重新换成了毒瓦斯的注入筒。
“简直如同观看笼子里拼命挣扎的大猩猩似的..”一位目击屠杀全体“原木”的队员这样说。
“原木”中有几个尚未被毒瓦斯熏死，他们拼命敲打着铁门，发出可怕的哀鸣，痛苦地用手抓挠着自己的喉咙。特别班的队员手握毛瑟枪，慢慢地走近“原木”，对准他们的胸膛扣动扳机。“拖着杀死的‘原木’们的腿，把尸体一具接一具地扔到7栋楼旁边挖好的大坑里，浇上汽油和重油，点着了火..七三一的焚烧炉由于忙于烧毁人头标本，以及培养细菌的琼胶、大量的文件、器具，腾不出空来。..‘原木’的尸体很不容易燃烧，但是撤退却要分秒必争，脚底抹了油的特别班队员，烧毁尸体的作业刚刚进行了一半，就往上面匆忙地盖上点土逃跑了..因此，有的手脚还伸在土上面，根本起不到掩盖犯罪的作用。七三一部队干部看到这种情况，命令道：‘把尸体重新挖出来，完全烧毁！’那些担任挖掘瞪着眼睛僵硬的‘原木’一具具尸体任务的队员们，忍着剧烈的恶心，不断地挖着。”一位队员这样回忆道。
8月11日，满载着特别班成员和贵重资料的3列军车，从平房站七三一部队的专用铁路线上开出。
平房站里仍在忙碌着，来不及烧毁的标本被装上卡车运往松花江边，乘着夜色扔进江里。细菌培养器、冷冻设施、陶器炸弹等全部被逐一破坏。工兵在紧张地作业，“口号”栋的各个房间和走廊都被浇上了重油，放起了大火。在滚滚腾起的黑烟中，随着震撼整个设施的巨大声响，这座巨大的魔窟倒塌了。无数老鼠从动物舍逃往四周原野，田中斑建筑物里，逃出了几百万只跳蚤。队员和家属们每人发得1小瓶草味班发明的剧毒氰酸钾化合物，作为自杀用的。六神无主的人们被深深地卷进逃亡的巨大漩涡之中。
8月16日夜里，当满载逃亡队员和家属的列车在新京（长春）车站停车时，石井四郎手持蜡烛突然在站台上出现了。他眼里闪着困兽般的凶光，对着列车大声嚷道：“..日本战败了。你们马上要回日本内地去..但是，无论到了哪里，你们都要保守七三一的秘密。如果你们中间有谁泄露了军事秘密，我石井不管是上天还是入地，都要把泄露者找到。你们可要记住哪！”
回到日本的石井四郎，在东京新宿区办了个旅馆。 1945 年冬，他受到美国占领军的传唤，当远东军事法庭开庭之际，苏联曾要求审判和惩处满洲第七三一部队以石井四即部队长为首的官员。石井四郎连忙与GHQ（驻日盟军总部）联系，把秘密携带回国的七三一有关资料提供给美军，以求保身。
结果，美国政府决定：“对日军细菌战班子的所有队员都不作为战犯起诉。”
美军悄悄地让在中国上海被俘，关进收容所的北野政次（1942年至1945年之间任第七三一部队部队长）回到日本。极其秘密地安排了石井-北野会谈，使他们能统一口径，订立攻守同盟，应付审问。
GHO 的审问徒有形式。事后，美军把“石井四郎以下的领导干部下落不明，七三一构不成战犯”的解释通知苏联方面。这个进行过世界史上空前的细菌战，残杀“消费”了3000 多人生命的第七三一部队罄竹难书的罪恶，因为新的战争需要被掩盖了下来。
1945 年冬天至次年的初春，猛烈的鼠疫袭击了平房附近的广大地区。在初发源的那个村里，平均每天要死10 个人，400 户人家全部死光。恶魔部队的残骸上，依然散发着残害人类的腐臭。
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