第七三一部队是日本军国主义在侵略战争这块土壤上疯狂开放的黑花，同时又是以石井四郎为首的战争恶魔催化合成的狂虐的医学研究机关。嗜血嗜杀的侵略者，以其天良丧尽的思想把科学和战争联结在一起，残忍、冷酷地醉心于毁灭人类的各种实验。让我们看看这些钉在历史耻辱柱上的恶魔医师吧。
据第七三一部队的队员描述，部队长石井身材高大，身高超过1.80 米，蓄着胡子。经常一身戎装，胸前挂着勋章。口才很好，喜欢挺胸腆肚滔滔不绝地演讲。只要一有事，就把全体人员集中到63 栋的大礼堂，强调使命、布置任务、解说时局，手上缠着麦克风的软线，大声吼叫，以至队员们私下称他“耍把戏的猴子”。
石井对细菌战有种疯狂的迷恋，尽可能地利用一切条件和机会研究细菌武器。比如人体实验，活的“原木”、死的“原木”、健康的“原木”、感染病毒致死的“原木”，都是他研究的对象，甚至第七三一部队的队员、家庭、他的助手，一旦染上病毒，也都会成为他手术刀下、显微镜里的研究对象。
除前文提及的“石井式陶器炸弹”之外，还有制造细菌的方法、鼠疫菌寄生跳蚤体内的方法、鼠疫菌干燥保存法、鼠疫菌增毒的方法，以及许多设备、器械，都是这个恶魔般的“天才”研究创造的。
第七三一部队制造细菌，使用的是石并亲自创造发明的细菌培养器（加压式培养器），并亲自研究出短时期内能培养和繁殖大量细菌的工艺流程，为了制造大量的、经过培养仍然保持强烈毒性的鼠疫菌，石井和高桥班想出了给“原木”一个接一个“移注”鼠疫菌的办法。他们先给“原木”A 注射生苗疫苗，让他体内血腋、淋巴当中产生的抗体和鼠疫菌之间展开激烈的斗争，直至“原木”死去。在与抗体斗争中取胜的鼠疫菌，它的毒性相应地增强了。于是，把“原木”A 的血清再注射给“原木”B。浸入毒性较高的鼠疫菌和“原木”B 的抗体相斗争，就会产生更强烈的菌，然后把它再注射给“原木”C。这就是为培养出具有强烈毒性的菌株，而以“原木”生命架设的增毒桥梁。对其它细菌的增毒，也往往采用这种方法。
在增毒过程中，也有人奇迹般地活下来了，这些人的抗体变强了，对细菌具有较强的免疫力，从防疫研究上，他们是高“价值”的“原木”。可是老让这些免疫力特别强的“原木”活下来，就会让源源而来的新“原木”无法容身。于是，石井命令对“原木”采取“间苗”。将老“原木”处死。由特别班人员将他们从单人牢房带到特别处置室。以往曾多次作为被实验体的“原木”，怀着戒心不愿走出室外，特别班人员就对他们说：“决定释放你了，为了预防要注射疫苗。”“被带到特别处置室的‘原木’手腕上，‘噗哧’地扎上装有20CC 氯甲烷的注射针..不到1 秒钟，‘原木’就激烈地喘息，翻着白眼，呼吸困难，浑身起鸡皮疙瘩断了气。..这种‘间苗’多的时候，一个月要处置20 多个。..一度曾经徘徊在死亡线上，但最后得救的‘原木’，这回确定被子了。真是无情的事啊！”一个原队员这样回忆石井下命令“间苗”的情景。
石井是“夜猫子”型的工作狂，常常白天在部队长室里呼呼酣睡，一到晚上头脑就很清醒。他的口头禅是：“就七三一的工作，无论是什么样的小事，只要是建议，哪怕深更半夜也不要紧，请随时到我屋里来。”他自己也是一想到什么有关细菌研究和细菌战的主意，哪怕深更半夜了，也立即叫来副官吩咐：“集合干部，现在马上要开紧急会议。”
石井生活放荡，沉洒于酒色，经常出现关东军司令部有紧急事联系时，他的副官们一齐出动，分头在新京（长春）或奉天（沈阳）街上的酒店里一家一家地寻找部队长的事情。他还曾因贪污公款和财务帐目不清被收容审查。1942 年7 月，他又因侵吞公款，贪污腐败被革去第七三一部队长职务。也就是在这次解除职务后，他去了南京，在那里指挥了日军侵华战争史上臭名昭著的“浙赣作战”——大规模的细菌战。
1945 年3 月，石井重新就任第七三一部队的部队长，他把部队代号改称为二五二○二。5 月，他向部队提出：“实验阶段已经结束，今后，只有朝着实施细菌战的‘X 日’一路增产了。”
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