水雷封锁战在会战后期依然是中国海军的主要作战方式。在将江面所有航道标志毁掉破坏的同时，区分主要江段，设立了多个雷区。据当时的文件和报道，"各区附近分别划补助雷区甚多，先后在各区布雷1500余具。"各布雷小轮，在敌机不断轰炸下，不分昼夜，奋勇进行，平明、永平、楚发、远东、三星、达通、万利、楚吉、临昌、飞鹅等各布雷船，均因执行此项工作，相继牺牲于蕲春、田家镇、新洲、苇源口、李家洲、余家州、石灰窑、道士袱各处，储雷驳船亦复被炸不少"。
水雷战的效果也十分明显，仅以田家镇要塞保卫战为例。为增强防守，中国海军战前在田家镇江段布设了高达超过400枚的水雷。结果，"由于海军布雷甚多，区域甚广，虽田家镇已放弃达10日之久，两岸我守军尽撤以后，敌舰仍未敢深入"。
除设障阻塞和开展水雷战外，中国海军在武汉会战中还积极参加了各江上要塞的保卫战。经过前期作战，有的舰只已不适用于水面继续作战，于是将其舰炮拆卸下来，安设于要塞之上。此外，将海军陆战队所配备的野战火炮也一并固定部署在要塞上，形成可以远程火力封锁江面、打击敌舰的要塞火力点。如在田家镇布设舰炮16门、葛店布设舰炮门等。
长江各要塞保卫战，这些兵力都发挥了重要作用。如马当战役时，。经过几日连续激战，尽管日军空中、海上火力很猛，我其他防御作战部队遭受重大伤亡，但当"敌陆海空军向我要塞阵地进攻时"，仍见"我江防要塞守备部队在阵地上与敌人作战"据当时的报道，后来，随着日军水面和陆上兵力的不断增强，"致我守军在敌人陆、海、空军地面、水上、空中之包围中，进入极为难苦之战斗。"
在7月初的湖口要塞保卫战中，中国海军陆战队基层官兵展现出勇敢无畏、誓死保卫家园的战斗精神。尽管建制仅仅一个连，但面对"敌海空连续轰击，陆军不断强攻"，绝不弃守，反复血战，拼死抵抗，予敌以大大杀伤。
在田家镇要塞保卫战中，中国海军的要塞作战兵力取得了突出战果。先是在9月20日，以猛烈炮击打退了日军6艘军舰、11艘炮艇的进攻，后又在次日将14艘企图前来扫雷的日军炮艇一举击沉8艘，极大地鼓舞了战斗士气。在随后于10月下旬展开的葛店防御战中，要塞守军还以准确的炮火击沉了日军另外2艘舰艇。
纵观武汉会战，中国海军以弱抗强，在极端恶劣的条件下，以奋战御敌的决心和灵活机智的战术行动，在陆上和空中中方作战力量的配合下，积极顽强，尽管终因寡不敌众，战局失利，自损多艘战舰，但取得的先后击沉各型日军舰船超过50艘、击落日机10余架的战果令当时正处于全面抗战中的国人瞩目和赞许。
中国海军在武汉会战期间的积极奋战，一方面在很大程度上打乱和迟滞了日军大本营溯江而上直取武汉的原计划，速战速决被迫变成消耗性层层推进，正如战后史料所言，"沿江正面阵地，在我雷区封锁与海军炮队防守之两种力量控制下，从无一处被敌突破，使其不得不畏难而放弃其由水路进攻溯江西犯计划，而采用陆军迂回攻击之笨拙策略，因此适足达成我消耗战、持久战之目的，而完成歼灭战之任务。"另外一方面，以有效的战法消耗了日军的战争力量，为军事委员会制定的"持久消耗"战略作出了自身的贡献。此外，江上作战也有力配合了陆上的防卫性作战，延长、扩展了防御时间和空间，正所谓，"不知道给我们取得了多少有利时间，来做保卫大武汉的充分准备，并且藉以完成长江上游各项防战设施"。
回首往事，60余年过去了，当年中国海军在长江之上奋勇杀敌之声犹在耳旁。抚今追昔，不禁令人感慨万千。水兵虽勇，但一支只能苦战于国内大江之上的海军绝不是一支强大的、足以保卫国家领海、维护国家海洋权益的海军。海军的战场应该在、也必须在蔚蓝的大海之上、深蓝的远洋之中。
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