1925年7月，在中国共产党的倡议下，中国国民党把广东的大元帅制政府改组成委员制的国民政府，8月将广东的各系军队仿效苏联红军建制，统一整编为国民革命军5个军。蒋介石任第一军军长，周恩来任政治部主任。
叶剑英所在部队合并到第一军，他仍担任新编团团长兼两广盐务缉私处代办。
这期间，国民党内部左派与右派之间的斗争日趋尖锐激烈。在国民党右派的策划下，8月20日，廖仲恺遭到凶手的暗杀，以身殉国。廖的被害激起了广大人民群众的巨大愤怒，对他的悼念形成了一场革命斗争。叶剑英对廖先生的遇害，悲愤交加，发誓为廖先生报仇雪恨。他登门去看望廖夫人何香凝和年少的廖梦醒、廖承志姐弟，表示亲切慰问。他代表新编团全体官兵参加丧礼，并送上一副亲笔书写的挽联：念载尽忠党国，宏济时艰，赫奕大名满海内；崇朝遭狙云亡，天柱遽折，愁云暗淡笼羊城。
廖仲恺被害后，国民党内部的斗争更加激烈。右派分子争权夺利，互相倾轧。叶剑英对右派分子十分鄙视，坚持为确定的革命目标奋斗。1925年9月他为老同学张国森所著《云南讲武学校华侨同学旋粤记》写序，充分表现了他的志向和情操。这篇序言写道：“吾粤华侨留滇同学，先后归粤达三百人，尚无机会统一思想，向同一目标为吾党奋斗。类皆各尽所能，以供党务，扬镳分道，无畏至尊，年来事迹，莫之稽也。同学张君国森热心党务，辑留滇同学旋粤记成，以示余曰：为我序之。剑英忝辱同袍，返粤五年，勉随诸君子后，鸡鸣铁马，未渡黄河，社鼠城狐，依然窥伺。观吾同学为党奔驰于海内海外，以宣传为贡者，惭何可言。夫吾党革命尚未成功也，愿吾同学，手旋粤记而读之，益期奋勉党事，庶几此记可以赓续成之。安知夫英雄轶事，不为他年考据家之津梁乎！”
在此期间，窜逃闽赣边境的陈炯明，乘东征军回师广州平定杨、刘，清理廖案之机，重新纠集各路叛军约4万多人再次窜回韩江、东江地区，横行肆虐，荼毒生灵。一度归顺过来的杨坤如再度叛附陈炯明，盘踞惠州。而盘踞广东南路的邓本殷等叛军亦伺机蠢动，企图东西联合，夹攻广州。在这种形势下，国民政府命令国民革命军进行第二次东征。9月28日，国民政府军事委员会任命蒋介石为东征军总指挥。叶剑英率新编团，同张发奎的独立旅和张民达、许济旧部一起，随东征主力第一军，向东江进发。
叶剑英率部作战，于10月初进占淡水。他奉国民政府命令将所部改为党军第一支队，任支队司令，旋即奉命返回惠州及博罗等处作战。当时的《广州民国日报》于10月26日作了如下报道：“前建国粤军第二师叶参谋长剑英将所部新编团出发前方，业经前报。兹查叶氏抵淡水后，即奉国民政府命令，将所部改为党军第一支队，以叶为支队司令。同时蒋总指挥并以我军右翼，着着胜利，兵力十分充足，特准叶司令率所部回驻惠州城及博罗等处，加入中路作战。叶奉令后，已率部队开抵惠城候令进取云。”
据东征老战士刘耀枢回忆，10月13日，叶剑英率部配合友邻部队攻克惠州后，奉命留守惠州、博罗一带维持治安。11月，东江平定，广东革命根据地基本统一。
在两次东征中，蒋介石知道叶剑英文武双全，能攻善守，是个“儒将”，便于12月电令调其任嫡系部队教导师的团长。1926年1月12日《广州民国日报》上曾披露：“东征军第一支队队长叶剑英，于前次奉命出发东江，对于讨逆，颇著劳绩，现在粤局既已统一，临时名义，极应取消。前经蒋总指挥委叶氏为教导师第二团团长。”不久，教导师改为二十师，叶剑英被提升为副师长。
1925年，对叶剑英来说是不平凡的一年。他在军事上大展宏图，发挥出了杰出的才能。两次东征中，他不仅与苏联军事顾问加伦、罗加乔夫等亲密合作，朝夕相处，而且时常接触周恩来，在思想上深受其影响。同时，他还结识了徐彬如（广东大学中共地下总支书记）、熊锐以及包惠僧（教导师党代表）等共产党员，向他们借阅马列主义的书籍，请教时局和理论问题，对共产主义有了更多的理解。徐彬如回忆说，东征以后，叶剑英越来越靠近共产党，在政治上更加成熟了。
※第六章 随师北伐与加入中国共产党
一、在总预备队指挥部
1926年，随着广东革命根据地的统一，工农运动猛烈发展，人民群众要求国民政府出师北伐，用武力推翻帝国主义和封建军阀在中国的统治的呼声越来越高。这年2月，中国共产党中央委员会在北京举行特别会议，确定党从各方面推动广州国民政府的北伐。
北伐战争的直接打击目标是受帝国主义支持的北洋军阀。当时的北洋军阀内部，已处在四分五裂的状况中。但从表面上看，仍然是一个庞然大物，存在着三大势力：直系军阀首领吴佩孚，控制着湖南、湖北、河南三省和河北保定一带，约有兵力20万人，它的主力一时还在北方的南口一带进攻冯玉祥的国民军；原属直系，后成独立势力的孙传芳，盘踞于江西、福建、江苏、浙江、安徽五省，号称“五省联帅”，有军队20万人，战斗力比吴佩孚强；实力最雄厚的奉系军阀张作霖，控制着东北三省，热河、察哈尔、京津地区和山东，兵力有30万人。这三股军阀势力总共有兵力约70万人。而国民革命军方面，北伐开始时只有广东的六个军（何应钦的第一军，谭延闿的第二军，朱培德的第三军，李济深的第四军，李福林的第五军，程潜的第六军），后来归附的，有广西李宗仁的第七军和湖南唐生智的第八军，总共八个军。
叶剑英所在的第二十师归第一军建制。当时国民革命军的总兵力有13万人左右。从兵力数量上看，虽然双方对比悬殊，但北洋军阀的统治久失人心，内部勾心斗角，尔虞我诈，存在着深刻的矛盾，这就为北伐军利用矛盾各个击破，提供了机会。
针对敌我力量对比的实际情况，国民革命军在以加伦将军为首的苏联军事顾问的建议下，制定了集中兵力、各个歼敌的战略方针：首先向湖南、湖北进军，长驱直进，迅速消灭北洋军阀中最薄弱的吴佩孚主力，争取张作霖、孙传芳两部在一段时间内保持中立；待两湖战场取得胜利后，再引兵东向，消灭孙传芳部；最后，北上解决实力最为雄厚的张作霖部，统一全国。
根据这个作战方针，1926年5月，国民革命军第七军一部和第四军叶挺独立团等部作为先头部队，先行出兵湖南，援助正被吴佩孚的部将叶开鑫部击败而退守湖南衡阳的第八军唐生智部。7月9日，国民革命军在广州市东较场举行隆重的誓师大会，然后兵分三路，正式出师北伐。
出师之始，蒋介石让何应钦率部驻防汕头，任命他的亲信、第一军第一师师长王柏龄代理第一车军长。接着，他又令第一军担任总预备队，任王为总预备队指挥官，负责指挥第一、二师，随他北伐。叶剑英被调任总预备队指挥部参谋长。
总预备队沿粤汉铁路乘车向北前进，经湖南郴州、衡阳，于8月12日抵达长沙。同日，蒋介石偕苏联顾问加伦将军及邓演达、白崇禧、唐生智等高级将领在长沙召开军事会议，决定迅速进攻湖北，主力直趋武汉，对江西暂取守势。王柏龄、叶剑英奉命于8月25日，由长沙向岳州进发。攻下岳州后，蒋介石以岳州为北伐军后方，命王柏龄、叶剑英率总预备队在此驻扎待命。
二、参加南昌之役
9月6日，北伐军攻克汉阳、汉口。翌日，北伐军一部向江西进军。王柏龄、叶剑英奉命率预备队第一师自岳州开到浏阳集中，随即进占江西之铜鼓城，配合第六军东下攻打南昌。9月10日，北伐军程潜部第六军第十九师向南昌发起进攻，王柏龄、叶剑英率领第一师助攻支援。由于得到南昌工人、学生及省署警备队的内应，一举攻克南昌。①孙传芳听到南昌失守，大为震惊，迅速组织优势兵力夺回南昌。蒋介石闻讯，与加伦将军亲临前方督战，再攻南昌。加伦分析战场情况后，提议休整两周，集结力量，再重新组织进攻。但是，王柏龄不听加伦的劝告，争功逞能，急于进攻。
①访问慕中岳、李任夫谈话记录，1984年12月11日。
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