章太炎，名炳麟，浙江余杭人。曾入诂经精舍读书，师从经学大师俞樾，后来成为著名的经学大师。不料，甲午战争的风云惊扰了他书斋的安宁，性情秉直、关注时局的章太炎，拍案而起，随即申请加入强学会，并为维新派的《时务报》撰写了多篇宣传维新，救国图强的文章。
戊戌变法失败后，他被通缉，逃到日本。在这里他结识了孙中山，非常赞同孙中山的革命主张，旋即剪掉辫子，以示反清的决心。孙中山也很重视这位从书斋走出的革命家。在1902年章太炎第二次到日本时，孙中山将横滨兴中会的一百多名会员召集起来，在中和堂酒楼举行宴会，为章太炎洗尘。宴会开始时孙中山持杯起立，对章太炎和出席者说：“今天我们略备薄酒，为章先生洗尘。章先生乃是一代国学大师，对西学也很精通。学识渊博，文笔犀利，见解独到，救国图强不遗余力，是我们兴中会志同道合的朋友。让我们共同举杯，为欢迎章先生的光临，为反清革命的早日成功，干杯！”出席者同声响应，纷纷将杯中酒一饮而尽。章太炎也持杯回敬大家说：“兄弟虽是一介书生，却也懂得反清革命的意义，我愿意与孙先生订交，共图革命、反清兴汉！这里，我借花献佛，感谢孙先生和兄弟们的盛情，让我们为革命的早日成功，干杯！”这次聚会，意味着章太炎接受了孙中山的革命思想，成为与孙中山并肩战斗的革命战友了。
1906年6月，孙中山派人接他到日本，吸收他加入刚刚成立的同盟会，并出任同盟会机关报《民报》的主笔。他与孙中山密切配合，宣传同盟会的政治主张，很快就成为同盟会有威信的思想家和宣传家。不料，第二年章太炎就与孙中山发生了龃龉。缘由是日本政府发现孙中山搞反清活动，将他驱逐出境。临走时，孙中山接受了日本友人两笔17，000元的赠款。孙中山急需这笔经费发动武装起义，只给《民报》留下2000元作为经费。章太炎则希望得到更多的经费。当时孙中山行色匆匆，来不及向章太炎解释这样做的用意，却被用心叵测的人钻了空子。日本浪人和章太炎在日本的朋友刘师培的挑拨，致使脾气暴躁的章太炎对孙中山心生怨恨。他意气用事，将《民报》办公室的孙中山的画像取下摔在地上，还在报上刊登文章谩骂孙中山，呼吁免除孙中山的同盟会总理的职务。
孙中山回国后，为发动广东起义，派人到日本购买武器。章太炎对这种革命大局缺乏认识，只顾一己利益，仍然对孙中山划拨的经费不足耿耿于怀，心怀不满，竟然听信流言，公开泄露起义消息，给革命事业造成不可挽回的损失。孙中山对他极为不满，从此两人的隔阂进一步加深。
1908年底，日本政府封禁《民报》出版。章太炎想把《民报》迁往美国出版，但因经费不足，未能如愿。章太炎怨恨孙中山不拨经费，公然宣布与《民报》脱离关系。不料，第二年同盟会通过努力，《民报》又秘密出版。章太炎闻讯大动肝火，撰写了《伪“民报”检举状》，到处散发，指责汪精卫受命恢复的《民报》非法，并对孙中山进行攻击。不但如此，他还在1910年3月，与陶成章在东京成立光复总会，另立山头，公然与同盟会分庭抗礼。
1911年武昌起义胜利后，孙中山就任中华民国临时大总统。章太炎被聘为总统府枢密顾问，本来这是对这位老革命党人的重用，可是他却不识抬举，仍然与孙中山作对。他反对孙中山建议的以汉冶萍公司作抵押来向外国人贷款，反对定都南京，甚至连袁世凯当了大总统之后，解除黄兴的革命武装，他也表示赞同。可见，他为了与孙中山作对，以报当年的“经费”之仇，不惜与袁世凯同流合污。因此，1912年他被袁世凯任命为东三省筹边使。
1913年3月，“二次革命”爆发，此时的章太炎已经看清了袁世凯的嘴脸，反过来站在孙中山的一边。袁世凯恼羞成怒，借他回北平之际，将他软禁，直到袁世凯死去才获得自由。1917年9月孙中山在广州成立护法军政府，组织护法军，讨伐段祺瑞。这个阶段，章太炎被任命为护法军政府秘书长。他为尖锐复杂的护法运动组织动员和出谋划策，与孙中山配合得较好。
护法运动失败后，孙中山针对一些军阀要求的“地方自治”、“联省自治”，提出要结束中国的割据状态，实现革命统一。而章太炎则反对中央集权，鼓吹“联省自治”，甚至连后来孙中山倡导的国共合作，他都嗤之以鼻。
章太炎与孙中山交往的二十多年间，有过默契的合作，也有过反目成仇的岁月，合而分，分而合，几经周折，反复多变。1925年3月孙中山逝世后，治丧委员会在筹划陵墓的墓志铭时，大家推举国学功底极深的章太炎先生撰写。章太炎得到这个消息，很自负地表示：“从我与中山先生交谊之密、互知之深来看，他的墓志铭只有我能胜任，也只有我有资格写。”这样，他就为孙中山先生写了篇古朴典雅、凝练审慎的《祭孙公文》。不过，在中山陵建成后，作为中山陵建造总监的蒋介石，并没有用章太炎写的墓志铭，而是镌刻上孙中山生前手书的“天下为公”四个大字。章太炎为此十分恼怒，但也无力争回面子。
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