当希特勒决定将下一个征服目标定为苏联后， 他又敏锐地感到，可以将“海狮”计划变为掩护“巴巴罗萨”行动的欺骗计划，这样，既能对英国施加一定程度的压力，又不让苏联觉察德国的入侵意图。于是，希特勒于1941年2月6日下令，要尽可能给英国造成最惨重的损失，德国空军逐步加强了对英国的空中打击，这场轰炸就成了一场蓄意策划的骗局，其目的是“使人觉得对不列颠群岛的进攻计划将在1941年实施”。
其后，希特勒又命令德国陆军制定了两项西线作战计划，代号为“鱼叉”和“鲨鱼”，并有意泄露出去，目的是使英国确信，对英国人侵将在1941年8月1日开始。“鱼叉”计划要求，驻挪威、法国和丹麦的德军着手对英国实施两栖作战，“鲨鱼”计划内容和“海狮”计划相似。希特勒从A集团军群中抽调出三个野战集团军，公开作登陆的准备，摆出一副渡海作战的架势。由于希特勒确实想征服英国，“海狮”计划也确实存在，因此，这一切做起来就像模像样，煞有其事，更具欺骗性。不明真相的人还真的以为，德军大规模调动是为了进攻英国呢！
除了利用“海狮”计划作幌子以外，希特勒还制定了其他一系列的欺骗措施，以强化“巴巴罗萨”行动的欺骗效果。这些作战计划中，有真正要实行的作战计划，也有纯出于欺骗目的而制定的假作战方案，假计划渗杂于真计划之中，令人真假莫辨，搞不清希特勒下一步的征服目标到底是谁。大规模的德军东调因此而被掩饰一时。在这些真真假假的作战计划中，“马利他”战役是要征服希腊，“向日葵”战役是要入侵北非，两战役除了自身的战略意义外，更重要的是其欺骗意义，如A集团军群的东调就是在“马利他”战役的掩饰之下进行的。
另一些计划，如占领直布罗陀的“黑葡萄”战役、占领法国南部的“阿提拉”战役，则纯粹是纸上谈兵，喧嚣一时，完全是“巴巴罗萨”欺骗计划的一部分，旨在把人们的注意力从苏德边境移开。德军进占巴尔干，完全是德国侵苏之前的准备工作之一，这是不可能瞒过苏联情报机构的，但希特勒竟然利用巴尔干行动来掩护“巴巴罗萨”行动。他借口要在巴尔干地区采取军事行动，频繁地使用了波兰和捷克斯洛伐克的运输网，从而有效地掩盖了“巴巴罗萨”行动的准备工作。
希特勒成功地使斯大林相信，德军在东欧的调动是为了征服巴尔干，德军1941年4月、5月间在巴尔干进行的军事行动已经排除了它在6月份进攻苏联的可能性。大家都知道，苏联是一个大国，征服这么一个国家怎么也不可能一激而就。而且，苏联的天气多变，秋季大雨滂沦，道路泥泞，不利于装甲兵行动，冬天气候寒冷，更是不利于作战。因此，即使希特勒要发动侵苏战争，那也只能等待来年了。这样，尽管德国在巴尔干地区遇到的麻烦延缓了希特勒进攻苏联的步伐，但它有效地掩盖了“巴巴罗萨”行动的准备工作，从而为德军的突然袭击创造了良好的条件。
除了在军事上进行欺骗外，德国还利用各种机会散布假情报，旨在使苏联情报机构误入歧途。德苏的经贸合作一直在进行，《苏德互不侵犯条约》也被大肆渲染，在预定的进攻发起回到来前不久，德国最高统帅部宣传处还策划了一项欺骗行动。他们大张旗鼓准备迎接苏联贵宾。苏联客人下榻的宾馆里摆满了鲜花，挂起了红旗，晚上德国人还秘密装饰柏林火车站，以便迎接苏联客人。尽管这些准备工作都是秘密进行的，但没有宾馆服务人员和火车站职工的配合很明显是不行的，因此消息很快传了出去，秘密成了新闻。宣传处还散布谣言说斯大林即将到德国南部的巴登疗养，给人一种德苏关系友好的印象。
德国情报机构竭力隐瞒德军的大规模东调，为东线德军的出切寻找借口。如德军的机械化部队出现在波兰境内，宣传处说这是必要的“防范”措施，要保护胜利果实，反对可能的侵略。宣传处还利用电台的听众点播节目，让人觉得德军的精锐部队还在西线，东线德军仅仅是些老弱病残之辈。外国情报机构的无线电侦察机构经常可以听到这样的点歌节目：“近卫军官兵寄给他们受伤的连长三瓶‘亨尼西’酒，祝他早日康复。”
近卫军是德国的精锐部队，而亨尼西则是一种法国名酒。根据这个节目，人们很容易判断出，近卫军还在西线。甚至于当德国民众不得不承认东线出现了德军的精锐部队之后，宣传处还让他们相信，部队的集结是为了进行一场大规模的欺骗演习，目的是遏制苏联，保证对英战事的顺利进行。宣传处和陆军、空军总司令部配合，们东线部队下达了很多命令和情况通报，反复强调入侵英国对于战争的结局至关重要，必须将敌人的注意力转移到东方。希特勒甚至对苏联人讲，所谓“巴巴罗萨”行动计划确实存在，只不过它不是用来进攻苏联的，而是用来掩护德军进攻英国的欺骗计划。
德军将士也很快了解到，苏联人对德军在东线的集结并没有任何防物措施，德苏关系依然友好，头号敌人仍然是英国。在入侵前，纳粹宣传部长戈培尔亲自出马，在纳粹党的党报上写了一篇《克里特岛就是榜样》的文章，似乎人侵英国指日可待。在报纸出版后，德军统帅部下令没收这份报纸，但许多订户已经从邮局取到了报纸，外国情报机构费了好大的劲才弄到这份报纸，德国的欺骗目的很明显达到了。
德军发起进攻之前，有关“巴巴罗萨”的流言纷起，其中，既有反映“巴巴罗萨”行动的真实情报，也有纯出乎欺骗目的的假情报。希特勒平时就对其亲信讲：“我的想法你们永远不会知道。对于那些夸口说了解我的想法的人，我更是不会讲真话。”为了给德军在东线大量出现提供一个“合情合理”的解释，希特勒对其高级军官讲，“巴巴罗萨”行动是防止苏联改变其对德政策时的紧急计划，德军在东线集结是为了防止苏联“先发制人”的打击。他还竭力让德军下级官兵知道，加强苏德边境上的兵力是防御性的，德军在东线大量集结，只是增加苏德谈判中的筹码，逼迫苏联让步，确保对英战争的胜利。
对于德国的盟国，希特勒也不放心，竭力对它们隐瞒真相。除了芬兰较早知道德国的行动计划外，罗马尼亚、匈牙利都是在战争前夕才知道“巴巴罗萨”行动的详细计划，而意大利“领袖”墨索里尼，虽然说与希特勒是铁杆“哥儿们”，但他事先对“巴巴罗萨”计划也是一无所知。6月22日上午，他还在梦乡，他的女婿齐亚诺叫醒了他，从而看到了希特勒从外交途径转给他的信，才知道战争即将爆发。日本人则自始至终未被告知“巴巴罗萨”行动。1941年3月5日国防军最高统帅部第24号指令明确规定：“关于‘巴巴罗萨’行动不允许对日本有丝毫暗示。”
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